Родился в 1979 году в городе Кирово-Чепецк Кировской области в семье рабочих. В 1994 году окончил гимназию №1. В ПТУ-6 получил профессию электрогазосварщика, работал на химкомбинате.
24 ноября 1997 г. призван на срочную службу в Вооруженные силы Российской Федерации. В звании сержанта был направлен в 506 гвардейский омcп 27-й мcд (п.Тоцкое-2) на должность заместителя командира взвода.
В сентябре 1999 года в составе полка был направлен в Республику Дагестан для выполнения задач по проведению контртеррористических операций с силами бандформирований Шамиля Басаева и Хаттаба, вторгшимися с территории Чечни. Взвод гвардии сержанта С. Ожегова в поисках боевиков прочесывал дома, изымал имевшиеся у населения огнестрельное оружие и боеприпасы.
В октябре 1999 г. полк вступает на территорию Чечни, личный состав участвует в боях с мятежниками, наемниками-боевиками.
Для обеспечения продвижения федеральных войск к Гудермесу, полку была поставлена задача взять штурмом Терский хребет. По данным разведки, на пути движения 6 мср, в составе которой был гвардии сержант С.Ожегов, должны были находиться укрытия боевиков, т.н. «волчьи ямы», хорошо замаскированные огневые точки. Они обеспечили прорыв федеральных войск в глубь обороны противника. Сложная боевая задача была выполнена за одну ночь. А если бы не отважные действия гвардии сержанта С.Ожегова, террористы могли бы сопротивляться еще долго.
Было принято решение о представлении гвардейцев Ожегова и Ситкина (посмертно) к званию Героев России.
5 мая 2000 года Президент Российской Федерации подписал Указ о присвоении звания Героя России с вручением особого знака отличия – медали «Золотая Звезда» (№ 645) гвардии сержанту Ожегову Сергею Анатольевичу.
1 июня 2000 г. в Кремле Герою была вручена награда. Уволившись в запас и вернувшись на родину, Сергей Ожегов работал на заводе минеральных удобрений, инспектором надзора ИТК-11, в Управлении федеральной службы судебных приставов, методистом ГУ «Областной Дворец молодежи».
Сергей Ожегов умер 2 декабря 2013 г.
Его имя выбито на памятной стеле Героев, установленной у Дома офицеров Приволжско-Уральского военного округа в Самаре.